Este trabajo analiza la evolución que ha conseguido alcanzar el programa denominado Nueva Agenda de Cooperación y Desarrollo Fronterizo (NACDF), que viene siendo ejecutado por los gobiernos de Uruguay y Brasil desde 2002. El programa refiere a un conjunto amplio de políticas públicas para la mejora de la calidad de vida de los ciudadanos de la zona de frontera y sus contenidos incluyen un amplio conjunto de acuerdos binacionales y proyectos (más de 100) presentados en el período 2002-2013. Particularmente, el análisis refiere a las siguientes cuestiones. Primero, aborda el problema de la eficacia que este programa ha conseguido y para ello describe las principales características socio-demográficas de la zona de frontera; luego se concentra en la caracterización de los acuerdos y proyectos que se han presentado en el transcurrir de este tiempo, para lo que se creó una base de datos para el seguimiento, monitoreo y evaluación de acuerdos y proyectos de la NACDF. El texto también analiza el funcionamiento del sistema institucional de la NACDF y particularmente se plantea el problema de la influencia del modelo de relaciones intergubernamentales y de la gobernanza sobre las políticas públicas fronterizas en ambos Estados, con énfasis particular en el caso brasileño. Por último se presentan conclusiones y se identifican problemas críticos relevantes para la mejora de la calidad de la gestión de las políticas y proyectos que se ejecutan en dicho programa fronterizo.