Resumen: El objetivo de esta investigación consistió en evaluar el desempeño de un reactor anaerobio de flujo ascendente de biomasa inmovilizada (RAFABI) tratando un efluente hospitalario real. Se estudió la remoción de materia orgánica y toxicidad, por medio de análisis como UV254, DQO filtrada y determinación del porcentaje de inhibición en el crecimiento de la raíz de la cebolla. Los resultados mostraron que el proceso biológico estuvo estable durante los 287 días de operación continua, el valor medio de la relación AI/AP fue de 1.21±0.08, indicando que no hubo acumulación de ácidos en el sistema. Sin embargo, los valores de la eficiencia de remoción de DQO filtrada, 56±15% y UV254, 21±36%, no fueron representativos. La toxicidad se redujo en 50%. Con base en lo anterior, es necesario utilizar el reactor anaerobio en combinación con otros procesos como por ejemplo los procesos de oxidación avanzada, para continuar reduciendo la materia orgánica recalcitrante al proceso anaerobio. Se comprobó la capacidad que tienen los reactores anaerobios de biomasa inmovilizada para remover la toxicidad.